Главное правило JSGME — соблюдение правильной структуры папок. Внутри папки MODS каждый мод должен лежать в своей отдельной папке, внутри которой обязательно должна быть папка gamedata .
JSGME (Generic Mod Enabler) — это простая и легкая программа, которая позволяет включать и отключать модификации одним кликом, не заменяя файлы игры безвозвратно.
Хотите узнать, как правильно настроить порядок загрузки модов для избежания вылетов в Anomaly? STALKER Anomaly JSGME & MO2 Tutorial
Если при включении мода JSGME выдает предупреждение о том, что файлы уже изменены другим модом — это означает конфликт. Вам нужно будет либо выбрать один из них, либо искать специальный патч совместимости.